Нило-Столбенская пусть находится в центре известного озера Селигер, на территории небольшого острова. Со всех сторон его окружает чистая вода и нетронутая природа леса. Датой основания монастыря считается 1594 года. Построен он был по желанию преподобного Нила – именно он завещал возведение этого монастыря после того, как почти 30 лет прожил в этих местах.
Почти два столетия, с XVII по XIX век, Нило-Столобенская обитель считалась наиболее роскошной и богатой на всей территории России. Ее строительство и неоднократные реставрации привлекали к себе множество известных зодчих с разных уголков страны.
В период СССР обитель переживала не самые лучшие времена – ей удалось побывать и тюрьмой, и лагерем, в котором содержали заключенных из Польши (преимущественно военнопленных), и колонией для детей строгого режима. Была она и туристической базой. Только в 1990 году она снова перешла к православной церкви, здесь начали вести реставрационные работы.